सिकंदर लोदी ने आगरा को अपने साम्राज्य की राजधानी बनाया। 1489 और 1517 के बीच सिकंदर लोदी दिल्ली का सुल्तान था।
सर्वप्रथम शासक जो आगरा को अपनी राजधानी बनाया था, वह दिल्ली सल्तनत के सुलतान इब्राहीम लोदी (Ibrahim Lodhi) थे। वे लोदी वंश के आखिरी सुलतान थे और उनकी राजधानी दिल्ली में थी, लेकिन उन्होंने अपने शासकीय कार्यकाल के दौरान आगरा को अपनी राजधानी बनाई थी। यह घटना 16वीं सदी के आदि में घटी थी।
इब्राहीम लोदी का सुल्तान बनने के बाद, उन्होंने अपने पास की राजधानी को आगरा में स्थानांतरित किया और उसे अपनी सत्ता का केंद्र बनाया। इसके बाद वह दिल्ली की ओर से आगरा के साथ हुए संघर्ष में हार गए और 1526 में पानीपत के युद्ध में बाबर के हाथों हार का सामना करने के बाद उनका सुल्तानी राज अंत हुआ।