कूनो राष्ट्रीय उद्यान में वन्यजीवो के साथ ही कई प्रकार के वनस्पतियों की प्रजातियां भी पाई जाती है इस संरक्षित क्षेत्र की वनस्पतियों में एनोगाइसस पेंडुला वन और स्क्रब , बोसवेलिया और ब्यूटिया वन , शुष्क सवाना वन और घास के मैदान और उष्णकटिबंधीय नदी के जंगल शामिल हैं जबकि इस राष्ट्रीय उद्यान की प्रमुख वृक्ष प्रजातियों में बबूल, साल , तेंदू डायोस्पायरोस मेलानोक्सिलीन , पलाश , ढोक एनोगिअसस लेटिफोलिया , एकैकोस ल्यूकोफोलिया , जिजिपस मौरिटेरिना और जिजिपस जाइलोपाइरस शामिल है जबकि इस राष्ट्रीय उद्यान में पाई जाने वाली प्रमुख झाड़ीदार प्रजातियों में प्रेया फ्लेवसेन्स , हेलिसटेरेस इसोरा , हाँपबुश विस्कोसा , वीटेक्स नेगुंडो शामिल हैं इसके अलावा इस उद्यान की प्रमुख घास की प्रजातियों में हेटरोपोगोन कंटूरस , अप्लुड़ा म्यूटिका , एरिस्टिडा हिस्ट्रिक्स , थेन्डा वचाझिवाल्विस और सेन्क्रस क्यूनिगिस शामिल हैं |